Pro efektivní ochranu rostlin a živočichů je zásadní minimalizace negativních vlivů způsobených člověkem a jeho činností. Fragmentace krajiny je jeden z nejzávažnějších problémů současné druhové ochrany nejen v ČR, ale také ve světě (jenom v na českých silnicích zemře ročně miliony živočichů). Mezi další významné negativní vlivy patří také zemědělská činnost, ať již při používání přípravků na ochranu rostlin (POR) nebo unifikovaná péče o krajinu (např. plošná seč v období rozmnožování organismu apod.).