Pokud má některá z autorizovaných obalových společností záměr provést změnu způsobu ekomodulace určitého obalu či typu obalu, je povinna tento záměr oznámit ostatním autorizovaným obalovým společnostem a Ministerstvu životního prostředí, jež se na změně musí shodnout v rámci koordinace. V případě, že se autorizované společnosti a Ministerstvo životního prostředí na změně ekomodulace neshodnou, nelze tuto změnu realizovat.
Orgány státní správy lesů a Ministerstvo životního prostředí vykonávají státní (v případě Ministerstva životního prostředí vrchní státní) dozor nad dodržováním právních předpisů a na jejich základě vydaných rozhodnutí z movi úřední.