Poplatek za znečišťování ovzduší je splatný do 30 dnů ode dne doručení platebního výměru. Správu placení tohoto poplatku vykonávají příslušné celní úřady.
Právnická osoba pověřená Ministerstvem zemědělství podle je povinna poskytovat Ministerstvu zemědělství souhrnnou zprávu o provedených kontrolách a jejich výsledcích, a to v dohodnutém rozsahu vždy k 31. lednu za uplynulý kalendářní rok.