Živé exempláře CITES vybraných ohrožených druhů podléhají povinné registraci, kterou zajišťují krajské úřady. O registraci žádá vlastník nebo dlouhodobý držitel exempláře. Jako osvědčení o registraci exempláře je vydáván registrační list. Vlastníci či dlouhodobí držitelé exemplářů jsou povinni hlásit změny na exempláři, které jsou registrujícími úřady zaznamenány do registračního listu.
Provozovatel zařízení je povinen každoročně předávat krajskému úřadu v elektronické podobě zprávu s údaji o plnění podmínek integrovaného povolení v rozsahu stanoveném úřadem v integrovaném povolení.