U držitele osvědčení je průběžně, nejméně ale 1x za dva roky, ověřováno dodržování zásad správné laboratorní praxe a to Ministerstvem životního prostředí zřízenou právnickou osobou pro ověřování zásad (NIO SLP, Středisko pro posuzování způsobilosti laboratoří ASLAB, Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, veřejná výzkumná instituce) formou periodických kontrol testovacího zařízení nebo auditu studií. Kontrola dodržování zásad u držitele osvědčení je možná i mimo periodickou kontrolu na žádost správního orgánu.
Kontrola povinností souvisejících s geologickými pracemi
Ministerstvo na svém úseku kontroluje, jak orgány a organizace plní povinnosti stanovené tímto zákonem a předpisy vydanými na jeho základě; je oprávněno uložit, aby byly ve stanovené lhůtě odstraněny zjištěné nedostatky.